Realizując swoje cele statutowe, PTSJ organizuje i współorganizuje krajowe i międzynarodowe konferencje, sesje i warsztaty naukowe.
Dotychczas organizowaliśmy lub współorganizowaliśmy wydarzeń naukowe we współpracy z następującymi organizacjami: Instytut Judaistyki UJ, JCC Kraków, Żydowski Instytut Historyczny, Muzeum Historii Żydów Polskich POLIN, Katolicki Uniwersytet Lubelski, European Association for Jewish Studies. Wśród nich:
I INTERDYSCYPLINARNA KONFERENCJA POLSKIEGO TOWARZYSTWA STUDIÓW JIDYSZYSTYCZNYCH
„Studia nad językiem i kulturą jidysz w Polsce – przemiany, wyzwania i perspektywy” (Kraków, 7–9 maja 2013)
II INTERDYSCYPLINARNA KONFERENCJA POLSKIEGO TOWARZYSTWA STUDIÓW JIDYSZYSTYCZNYCH (Warszawa, 12-13 maja 2019)
„Studia nad językiem i kulturą jidysz w Polsce. Przemiany, wyzwania i perspektywy” (Warszawa, 12-13 maja 2019)
III INTERDYSCYPLINARNA KONFERENCJA POLSKIEGO TOWARZYSTWA STUDIÓW JIDYSZYSTYCZNYCH
„Jidyszland – nowe przestrzenie” (Warszawa, 20-21 listopada 2022)
„W KRĘGU PERECA”. MIĘDZYNARODOWA KONFERENCJA NAUKOWA (współorganizator)
Warszawa-Zamość, 7–10 września 2015 współorganizatorzy: Muzeum Historii Żydów Polskich POLIN, Polskie Towarzystwo Studiów Jidyszystycznych, Fundacja Ochrony Dziedzictwa Żydowskiego oraz Międzynarodowy Ośrodek Badań nad Historią i Dziedzictwem Kulturowym Żydów Europy Środkowej i Wschodniej Katolickiego Uniwersytetu Lubelskiego Jana Pawła II
„YIDDISHISM: MYTHOLOGIES AND ICONOGRAPHIES" (współorganizacja)
Warszawa 15–16 listopada 2015, współorganizatorzy: Pracownia Badań nad Kulturą Jidysz Żydowskiego Instytutu Historycznego, Maison de la Culture Yiddish — Bibliothèque Medem w Paryżu, Polskie Towarzystwo Studiów Jidyszystycznych, Fundacja im. Michała Friedmana.